Вообще, информации об одном из древнейших мест Смоленска не так много. Известно, что здесь (на месте настоящего Авраамиева монастыря) епископ Игнатий построил церковь во имя святого Игнатия Богоносца, а потом — во имя Богородицы Положения честныя ризы и пояса. Храмы обросли кельями, появился монастырь. Он был прославлен после прихода преподобного Авраамия.

Несколько веков истории собора, как и монастыря, стираются. Зато всей России известно, что монахи Авраамиевского монастыря участвовали в обороне Смоленска от польского войска, но монастырь все равно разграбили поляки. Самая большая потеря того времени — исчезновение из монастыря мощей преподобного Авраамия.

Ближе к середине 18 века в комплексе монастыря появился двухэтажный каменный храм. В нем находились престолы во имя Преображения Господня, в память преподобного Авраамия и Меркурия Смоленского. Храм получил название Преображенского, а монастырь стал называться Спасо-Авраамиевым. В 1773 году недалеко от главного храма была построена каменная Введенская церковь.

Во время Отечественной войны храм разграбили французы и разместили в нём хлебный магазин, вывезя все ценное.

В период после революции монастырь закрыли и сделали в нём концентрационный лагерь. Всех жителей монастыря убили. Мощи преподобного Авраамия так и не нашли, а сам монастырь тогда передали военному ведомству.

На данный момент в одном из зданий монастыря расположено лечебное учреждение, в другом городские квартиры. В главном храме раньше располагалось книгохранилище областной библиотеки.

В рамках федеральной программы здания монастыря были отреставрированы в 2013 году, о дальнейших планах (подобных уже проведённым работам) неизвестно.